Esas imágenes (realmente geniales) fueron creadas por David Goodsell utilizando un software personalizado.

De una entrevista al artista:

PDB : ¿Cómo se crean las ilustraciones?

Goodsell : La mayoría de las imágenes se crean con un programa informático que desarrollé cuando era haciendo trabajo postdoctoral con el Dr. Art Olson aquí en The Scripps Research Institute. He estado usando este estilo de ilustración, con colores planos y contornos negros, durante unos 10 años. Me gusta la forma en que este estilo simplifica la molécula, dando una idea de la forma general y la forma de la molécula, pero al mismo tiempo todavía se pueden ver todos los átomos individuales. En la última página de cada molécula del mes - "Explorando la estructura" - siempre uso RasMol, para darles a los visitantes una idea de los tipos de imágenes que pueden crear ellos mismos con software estándar.

Existen buenas herramientas si quieres replicar ese aspecto. Aunque puede que requiera algunos ajustes (y posiblemente programación), seguramente le daría una oportunidad a PyMOL y Bioblender.

En realidad, no considero que estas imágenes sean "hermosas" o "geniales", no son de mi gusto, y no estoy realmente seguro de que la pregunta sea sobre biología, pero como ha resurgido después de casi 5 años. Pensé en dar una respuesta que explicara cómo se podría crear algo similar, en lugar de cómo se hicieron realmente.

El programa de gráficos 3D original que se usó fue RasMol , pero como eso solo se ejecuta en Windows, no se ha actualizado durante años y no tiene una versión web viable, sugeriría usar JMol / JSMol en su lugar. Puede descargar la aplicación y trabajar con ella como se describe en mi respuesta a una pregunta anterior. Alternativamente, puede encontrar una página web con una ventana JSMol (como una página utilizada en mi propio material didáctico) y utilizarla con la consola disponible en el logotipo de JSMol. Entonces, lo que hago es:

1. Obtener el archivo PDB con el que quiero trabajar del Protein Data Bank.
2. Arrastrarlo a la ventana de JMol cuando la molécula se cargue en wireframe modo como en (A), a continuación.
3. Dé una serie de comandos como los siguientes para obtener una imagen de relleno de espacio (B) en colores distintos de CPK (puede especificar los colores de las cadenas si lo desea ) y sin los parches de luz brillante, que están bien para imágenes estándar, pero causarán problemas. La belleza de JMol es que puede generar imágenes de alta resolución que puede arrastrar de nuevo a una ventana de JMol y trabajar de nuevo más tarde (siempre que no las haya editado).

 restringir proteína estructura alámbrica de proteína seleccionada relleno de espacio en cadenas de color establecer especular apagado escribir pngj 2000 2000 "my.png" 

4. A continuación, necesita acceder a una aplicación de gráficos de mapa de bits decente. Si estás en una universidad, alguien tendrá una copia de Photoshop (las versiones antiguas están bien), pero de lo contrario tendrás que conformarte con lo que puedas encontrar. Estoy casi seguro de que el artista original habría desarrollado el estilo que usa con Photoshop. Dice que él mismo escribió un programa para automatizarlo, pero en mi opinión, podría haber usado bien un script de Photoshop (Acción). Cualquiera, para uso ocasional, simplemente hágalo de forma interactiva.

5. Lo primero que debe hacer es colocar los contornos en las esferas y hacer que los colores sean planos. El primero se realiza con un filtro que busca los bordes, y el segundo mediante la posterización (reduciendo el número de colores en la imagen). Usé un filtro llamado 'Poster Edges' para producir C. Hay controles deslizantes que le permiten cambiar la intensidad de los bordes y el grado de posterización.

6. Finalmente, para reproducir el bastante sensación de desteñido de los colores Utilicé la herramienta 'Exposición' (Imagen> Ajustes> Exposición), pero podría haber utilizado curvas (Imagen> Ajustes> Curvas) o, sin duda, otras opciones.

Y ahí tienes la imagen final en D. No tiene la misma posterización que la ADN Helicasa ilustrada en la pregunta, pero si realmente lo desea, puede experimentar.